Da mein Cabrio ein 3er ist mit ex 75PS 1,8i kann ich dir nur von den Erfahrungen heraus berichten.
Ich fange mal bei den handwerklichen Arbeiten an:
Am einfachsten ist es wenn man ne Lochstanze nimmt ähnlich wie die bei nem Waschbecken für Armaturenlöcher nur größer. Damit kann man sich ein Zusatzloch für die Kabeldurchführung zur ZI in die Schottwand machen. Gleiches gilt für die Befestigung des Hydraulikgebers für das Getriebe. Bei mir paßte der Schaltpaul. Ein Freund von mir mußte bei seinem Wagen zwei neue Löcher bohren zum Befestigen. Für die Hinterachse brauchte ich neue ABS Sensoren da die VR falsche Stecker hatte. Aufgrund der Bremslastverteilung mußte ich ein Bremsröhrchen neu bördeln und verlegen.
Ansonsten habe ich getauscht:
Achsen inklusive Bremsesystem (ABS ist das alte geblieben)
Bei der Vorderachse war das Mittelteil (inklusive Servolenkung) gleich wie das vom 75PS Golf. Da hätte es gereicht nur die Achsaufhängung und den Stabi etc zu tauschen.
Benzinpumpe (Tank ist der alte kleine geblieben)
Motorlager
Motor/Getriebe/Antriebswellen
Motorkabelbaum
Tacho
Schaltpaul (Züge anstatt Gestänge)
Auspuffanlage
Räder (5Loch) und Reifen (Traglast)
Pedalstock (wegen dem Hydraulikgeber Kupplung)
Lenkstock inklusive Kabel
das wars meine ich bei mir gewesen. Allerdings hatte ich ne euro 2 Abgasnorm und der Schlacht VR hatte sie ebenfalls.
Bei dir würde ich eher den V6 aus nem Golf 4 verbauen. Da das 3,5er Cabrio meines Wissens nach Euro 3 hat und es kein 12Ventiler VR6 mit Euro 3 gibt. Ausserdem hast du beim V6 den Vorteil des Schaltsaugrohrs was dir deutlich mehr Druck aus dem Drehzahlkeller sowie etwas geringeren Spritverbrauch bringt. Kleiner Nebeneffekt ist die Mehrleistung des V6. Nachteil ist das elektronische Gaspedal welches zusätzlich gewechselt werden darf.
Der Block vom V6/R32 ist von der Aufhängung gleich dem VR womit das VR Getriebe inklusive Achsen etc sauber ran paßt. Somit hast du keine wirklichen Probleme beim Einbau und mußt keine Antriebswellen anpassen etc.
Wenn du noch Fragen hast kannst du auch gerne mal anrufen. Tel Nr gibts ggf. per PM.
Um dich schon mal ein wenig drauf einzustimmen hier ein Link von meiner never ending Story:
http://www.vr6.de/viewtopic.php?t=17643